Adamis-cluster

Logiciels installés

Voici la liste des softs disponibles sur le cluster :

  • gnu compilers 4.7.2
  • octave (+forge,headers) 3.2
  • idl 7.0
  • torque (plus d'info sur le pbs ici?
  • mpich 1.2 (version gcc)
  • camb / camb_fits (bin)
  • healpix 2.15 (/usr/local/lib/healpix/src/idl)
  • healpic_cxx 2.11 (bin+lib+headers) (/usr/local/bin;/usr/local/lib;/usr/local/lib/idl) patché pour accélérer l'écriture sur les systèmes de fichier réseau (et les autres aussi d'ailleurs) pour appliquer les patchs hppatch.tgz? aux futures versions (si elles ne changent pas trop) utiliser les commandes :
    tar xvzf hppatch.tgz patch -p1 < HPpatch01.diff patch -p1 < HPpatch02.diff
  • astron version d'août 2010 (par défaut) (/usr/local/lib/idl/astron) La version d'août 2007 est également disponible à /usr/local/lib/idl/astron_aug_2007
  • unison, pour synchroniser (une partie de) votre compte APC avec celui du cluster.
  • Intel Fortran et debuggueur: (que sur le noeud maître pour l'instant )
    • ifort 10.1 (faire un source /usr/local/intel/fce/10.1.008/bin/ifortvars.[c]sh )
    • idb 10.1-32 (faire un source /usr/local/intel/idbe/10.1.008/bin/idbvars.[c]sh )
  • libgsl0-dev installée sur tous les noeuds
  • sextractor
  • Hdf5-1.6.5 (version (Gnu) gcc/g++)
  • Pgplot5
  • OpenMpi-1.3 (par défaut)
    • ajouter dans LD_LIBRARY_PATH /usr/local/openmpi/lib/:/usr/local/openmpi/lib/openmpi/
    • ajouter dans PATH /usr/local/openmpi/bin
    • ATTENTION : si vous n'utilisez pas ce PATH, vous travaillerez avec mpich (built-in Debian avec gcc-4.3-2)
  • Hdf5-1.6.6 (version Intel)
    • ajouter dans LD_LIBRARY_PATH /usr/local/hdf5/lib
  • Qt-3.3.8
    • ajouter dans LD_LIBRARY_PATH /usr/local/qt
  • Cmake-2.4
  • Vtk
  • Visit 2.6.2 : /usr/local/visit2_6_2.linux-x86_64/bin/visit
  • Visit 1.10 ajouter setenv LIBGL_ALWAYS_INDIRECT y
  • Paraview 3.14 (64 bits)
    • ajouter dans PATH /usr/local/paraview/bin et setenv LIBGL_ALWAYS_INDIRECT y
  • Scons 2.0
  • ImageMagick 8:6.6.0.4-3
  • Python2.7
  • Python numpy 1.6.2
  • Python matplotlib 1.1.1
  • doxygen 1.7.1-2
  • texi2html 1.82-1
  • healpy 0.9.6.3
  • GDL (gnu data language)
  • fftw3.3.1 multithread (paquet debian) et fftw 2.5.1 mpi (/usr/local)
  • ds9
  • xerces-C++_3.1.1 (lib, x86, gcc-3.4)
    • ajouter dans LD_LIBRARY_PATH /usr/local/xerces-c-3.1.1-x86_64-linux-gcc-3.4/lib
    • ajouter dans PATH /usr/local/xerces-c-3.1.1-x86_64-linux-gcc-3.4/bin